More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1938 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
263 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  77.27 
 
 
307 aa  348  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.7 
 
 
286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.75 
 
 
301 aa  319  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.3 
 
 
265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.05 
 
 
262 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.4 
 
 
303 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.06 
 
 
309 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65 
 
 
301 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  62.93 
 
 
301 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.25 
 
 
301 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.25 
 
 
303 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.45 
 
 
311 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.25 
 
 
303 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.89 
 
 
304 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.47 
 
 
307 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.62 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.98 
 
 
278 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.75 
 
 
299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.62 
 
 
300 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.64 
 
 
241 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.89 
 
 
239 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.11 
 
 
242 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.42 
 
 
238 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.42 
 
 
238 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.44 
 
 
238 aa  208  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.06 
 
 
240 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.42 
 
 
238 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.95 
 
 
242 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.39 
 
 
243 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.95 
 
 
242 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.38 
 
 
273 aa  198  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096277 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.95 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.95 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.95 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.95 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.47 
 
 
242 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.75 
 
 
243 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.9 
 
 
243 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  47.75 
 
 
242 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.47 
 
 
242 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.47 
 
 
242 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.9 
 
 
244 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.46 
 
 
243 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.9 
 
 
244 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.9 
 
 
244 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.64 
 
 
242 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.49 
 
 
243 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.46 
 
 
243 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.66 
 
 
234 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.85 
 
 
243 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.42 
 
 
233 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.59 
 
 
246 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  47.93 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0016  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  47.27 
 
 
262 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 
250 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.91 
 
 
253 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.07 
 
 
230 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.66 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.66 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.37 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.89 
 
 
247 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.63 
 
 
254 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  41.63 
 
 
254 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.38 
 
 
201 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.50819  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.93 
 
 
250 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.08 
 
 
250 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.85 
 
 
237 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.28 
 
 
254 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.47 
 
 
253 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.02 
 
 
238 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.44 
 
 
266 aa  148  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  40.45 
 
 
253 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.82 
 
 
253 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
238 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.47 
 
 
222 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
238 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
238 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.11 
 
 
236 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.28 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.63 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.63 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.04 
 
 
222 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.54 
 
 
232 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  38.79 
 
 
230 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.17 
 
 
222 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.19 
 
 
237 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  38.79 
 
 
235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.79 
 
 
235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.54 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.54 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  40.38 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.19 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  40.38 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>