70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1933 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  806    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1961  hypothetical protein  52.67 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2361  hypothetical protein  50.79 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2874  hypothetical protein  50.79 
 
 		 370 aa  327  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1649  hypothetical protein  49.87 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1780  hypothetical protein  48.53 
 
 		 387 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2872  hypothetical protein  48.83 
 
 		 377 aa  292  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0270524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1626  hypothetical protein  45.09 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2702  hypothetical protein  46.88 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2243  hypothetical protein  45.41 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3073  hypothetical protein  45.27 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0856  hypothetical protein  43.3 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3629  hypothetical protein  43.59 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2036  hypothetical protein  41.33 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2245  hypothetical protein  42.5 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1432  hypothetical protein  43.85 
 
 		 377 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62375  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2129  hypothetical protein  44.33 
 
 		 380 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325483  normal  0.257058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1764  hypothetical protein  42.24 
 
 		 378 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.862195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1754  hypothetical protein  42.08 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15270  hypothetical protein  46.19 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0260789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1857  hypothetical protein  43.43 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0133  hypothetical protein  45.71 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2411  hypothetical protein  41.96 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1000  hypothetical protein  41.38 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1467  hypothetical protein  42.05 
 
 		 377 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27200  hypothetical protein  41.69 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0597023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3857  hypothetical protein  41.92 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0935  hypothetical protein  42.38 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224232  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2303  hypothetical protein  41.39 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000136711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1897  hypothetical protein  37.77 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0850  hypothetical protein  41.13 
 
 		 393 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0187674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1070  hypothetical protein  42.86 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000120552  normal  0.185672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2890  hypothetical protein  41.02 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780148  normal  0.230135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1094  hypothetical protein  40.24 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4000  hypothetical protein  39.95 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000276231  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1018  hypothetical protein  40.67 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0566  hypothetical protein  42.72 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2162  hypothetical protein  39.9 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2244  hypothetical protein  37.76 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000119779  decreased coverage  0.0000000000494195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2140  hypothetical protein  38.74 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000016162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1022  hypothetical protein  40.99 
 
 		 395 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1738  hypothetical protein  39.95 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2269  hypothetical protein  39.08 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000211648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2231  hypothetical protein  37.54 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000496649  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1916  hypothetical protein  38.82 
 
 		 389 aa  207  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000231696  unclonable  0.0000021691 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4517  hypothetical protein  37.54 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1876  hypothetical protein  37.05 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000489639  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2770  hypothetical protein  40.81 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1938  hypothetical protein  37.54 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000960978  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2037  hypothetical protein  35.97 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000141693  hitchhiker  0.000596189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1100  hypothetical protein  39.08 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1991  hypothetical protein  35.91 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2823  hypothetical protein  40.77 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0821891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1781  hypothetical protein  40.77 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2140  hypothetical protein  35.97 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000144093  hitchhiker  0.0000349236 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2831  hypothetical protein  40.77 
 
 		 406 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2885  hypothetical protein  40.77 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1700  hypothetical protein  36.67 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000144386  normal  0.0296487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1909  hypothetical protein  35.37 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00034683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0551  hypothetical protein  40.5 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2458  hypothetical protein  40.5 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2338  hypothetical protein  36 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322197  hitchhiker  0.000102479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2190  hypothetical protein  36.67 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  unclonable  0.00000574894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4254  hypothetical protein  39.23 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1142  hypothetical protein  38.35 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0662  hypothetical protein  38.46 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2050  hypothetical protein  35.15 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000198084  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2329  hypothetical protein  37.12 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0422  hypothetical protein  36.7 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0414  hypothetical protein  37.34 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0586317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>