More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1917 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  84.03 
 
 		 267 aa  474  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  73.88 
 
 		 284 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  75.09 
 
 		 275 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  72.83 
 
 		 269 aa  421  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  71.43 
 
 		 267 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  70.57 
 
 		 266 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  73.03 
 
 		 277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  68.94 
 
 		 266 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  68.01 
 
 		 274 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3100  methionine aminopeptidase, type I  73.61 
 
 		 271 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.612073  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  67.42 
 
 		 272 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  67.79 
 
 		 270 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  67.42 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  67.18 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  67.18 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  65.92 
 
 		 272 aa  377  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  67.18 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  67.18 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  67.18 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2179  methionine aminopeptidase  70 
 
 		 276 aa  377  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0164635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  67.18 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  67.18 
 
 		 271 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  70.26 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  66.8 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  66.29 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  70.26 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  66.04 
 
 		 275 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  70.26 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  65.79 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  66.79 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  70.52 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  65.75 
 
 		 258 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  66.15 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  68.05 
 
 		 271 aa  362  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  63.81 
 
 		 269 aa  358  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2456  methionine aminopeptidase  68.54 
 
 		 269 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00862803  hitchhiker  0.000816397 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  63.81 
 
 		 269 aa  358  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1680  methionine aminopeptidase  68.16 
 
 		 269 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119915  normal  0.0588889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1922  methionine aminopeptidase  67.8 
 
 		 271 aa  357  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  66.29 
 
 		 271 aa  357  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  66.29 
 
 		 271 aa  357  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  67.32 
 
 		 260 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  66.54 
 
 		 271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  67.32 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  67.32 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  64.96 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2053  methionine aminopeptidase  66.92 
 
 		 271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.73605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  65.75 
 
 		 261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  65.75 
 
 		 261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5330  methionine aminopeptidase  67.05 
 
 		 271 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0698581  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  66.93 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  64.96 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  65.23 
 
 		 260 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  66.54 
 
 		 260 aa  350  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  63.67 
 
 		 260 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  62.21 
 
 		 258 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  63.67 
 
 		 260 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  63.28 
 
 		 260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  62.55 
 
 		 255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  62.6 
 
 		 261 aa  338  7e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  62.65 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  62.2 
 
 		 256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  60.94 
 
 		 259 aa  334  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  60.94 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  63.53 
 
 		 264 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  62.99 
 
 		 254 aa  332  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  60.77 
 
 		 258 aa  332  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  62.99 
 
 		 254 aa  331  6e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  60.63 
 
 		 262 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  61.6 
 
 		 284 aa  328  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  62.75 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  60.62 
 
 		 274 aa  325  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 		 264 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 		 264 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 		 264 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 		 264 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  63.14 
 
 		 264 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  58.24 
 
 		 275 aa  322  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  60.56 
 
 		 263 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  61.02 
 
 		 258 aa  321  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  60.87 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 273 aa  318  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>