More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1878 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  69.71 
 
 		 215 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  64.59 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  64.11 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  60.1 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  57.89 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  62.8 
 
 		 220 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  61.46 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  60.51 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  59.72 
 
 		 228 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  60.64 
 
 		 200 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  60.53 
 
 		 203 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  58.71 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  58.55 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  60.22 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  60.22 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  60.22 
 
 		 206 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  60.22 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  60.22 
 
 		 206 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  58.1 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  52.04 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  57.51 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  55.1 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  60 
 
 		 206 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  61.62 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  57.14 
 
 		 204 aa  204  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  60.54 
 
 		 210 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  52.28 
 
 		 214 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  54.21 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 210 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  58.92 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  58.33 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  50.51 
 
 		 211 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  55.79 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  58.2 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  56.25 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  54.27 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  55.96 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  57.3 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  54.3 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  53.76 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  57 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  50.75 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  50 
 
 		 208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  44.27 
 
 		 211 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  50 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  48.37 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.5 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  48.37 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  50 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.66 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.78 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.72 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  48 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  47.32 
 
 		 217 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.91 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 215 aa  155  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  49.76 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.21 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  37.31 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.71 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  45.27 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 207 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  46.07 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  45.88 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.72 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  39.69 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  44.2 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.93 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.67 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  49.75 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>