39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1795 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  773    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  70.47 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  47.4 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  46.46 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  41.29 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  43.73 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  41.06 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  36.31 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  37.46 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  34.92 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  36.77 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.28 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  35.52 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  35.52 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  34.82 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  38.17 
 
 		 408 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  36.34 
 
 		 424 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  34.73 
 
 		 429 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  40 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  36.02 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  37.57 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  34.84 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  36.53 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  39.58 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  37.28 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  36.57 
 
 		 400 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  34.59 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  35.47 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  35.4 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  35.71 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  36.3 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  35.26 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  36.02 
 
 		 395 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  34.69 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  22.07 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.64 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>