More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1765 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.45 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  36.94 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  36.95 
 
 		 456 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  36.23 
 
 		 456 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.45 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 456 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.02 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  37.98 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.41 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.93 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.96 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.87 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.24 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.86 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  31.72 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  34.95 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.68 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  33.65 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.55 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.32 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.04 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.98 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  30.69 
 
 		 228 aa  99  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.49 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  33.63 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.02 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  28.5 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  30.36 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.84 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  35.91 
 
 		 176 aa  92  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.65 
 
 		 193 aa  91.7  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  32.64 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  31.05 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.89 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  35.11 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  29.74 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.66 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.77 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.56 
 
 		 735 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  30.53 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  34.74 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.5 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  34.95 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.41 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.65 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.13 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  34.38 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  34.95 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  34.95 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3605  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.35 
 
 		 197 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.12 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.86 
 
 		 200 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  32.64 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  30.53 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  37.11 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  37.11 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  34.44 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.64 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.04 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  30.59 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  30.59 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  30.23 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  30.59 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  30.59 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  30.59 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  25.89 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.98 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.88 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.55 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.98 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.8 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.24 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>