273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1721 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.33 
 
 
279 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  76.4 
 
 
281 aa  354  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  69.89 
 
 
284 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.4 
 
 
275 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  60.22 
 
 
275 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.09 
 
 
523 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.27 
 
 
275 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.09 
 
 
523 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  60.15 
 
 
276 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  53.56 
 
 
518 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  54.89 
 
 
521 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  58.65 
 
 
275 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  58.09 
 
 
277 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  60.53 
 
 
275 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.15 
 
 
275 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  60.96 
 
 
431 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  60.45 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  60.92 
 
 
277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 
294 aa  158  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  47.47 
 
 
576 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.69 
 
 
576 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  48.52 
 
 
576 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
271 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.81 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  41.38 
 
 
256 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
277 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
277 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  41.38 
 
 
256 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 
269 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  35.84 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
259 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  37.02 
 
 
261 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  37.02 
 
 
261 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
259 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
259 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
259 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
298 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.59 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  38.36 
 
 
252 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.84 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.63 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.55 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  33.09 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.63 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.63 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
280 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  47.35 
 
 
570 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
271 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
270 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
271 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
271 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  34.96 
 
 
255 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  46.15 
 
 
255 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.16 
 
 
266 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  35.75 
 
 
271 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.44 
 
 
272 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
271 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
271 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35 
 
 
365 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
271 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
253 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
271 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.91 
 
 
255 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  33.47 
 
 
276 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.18 
 
 
341 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.18 
 
 
341 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.19 
 
 
277 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  35.95 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.86 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  40.76 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  39.49 
 
 
294 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
290 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.37 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.37 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  36.41 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.64 
 
 
255 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.93 
 
 
262 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
255 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.93 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  33.05 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  34.1 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.05 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  38.61 
 
 
289 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
539 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  32.22 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2680  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  35.68 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  30.3 
 
 
264 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 
264 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.75 
 
 
294 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>