More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1683 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  78.49 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  68.94 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  69.49 
 
 		 272 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  68.56 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  68.28 
 
 		 269 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  67.8 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  68.38 
 
 		 272 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  69.6 
 
 		 273 aa  364  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  70.79 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  70.63 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  69.78 
 
 		 269 aa  360  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  68.94 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  69.03 
 
 		 269 aa  358  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  66.54 
 
 		 270 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  68.82 
 
 		 272 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  65.91 
 
 		 265 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  70.83 
 
 		 271 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  66.19 
 
 		 279 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 271 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 271 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 271 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  66.17 
 
 		 271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  65.41 
 
 		 270 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  66.29 
 
 		 265 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  59.25 
 
 		 265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 271 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 271 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 271 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 271 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 271 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 271 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 271 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  60.23 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  58.11 
 
 		 265 aa  317  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  59.09 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  62.41 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  65.91 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  60.3 
 
 		 268 aa  309  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  57.58 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  54.18 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  53.33 
 
 		 271 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  52.43 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  58.36 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  62.81 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  55.81 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  54.81 
 
 		 271 aa  272  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  47.94 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  55.22 
 
 		 274 aa  265  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  54.61 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  47.99 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  48.33 
 
 		 270 aa  258  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  47.79 
 
 		 272 aa  250  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  48.75 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  48.75 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  52.92 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 268 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  47.5 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  47.11 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  50.37 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  53.38 
 
 		 269 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  44.96 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  42.96 
 
 		 267 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  47.35 
 
 		 263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  44.21 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  44.31 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  53.02 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  43.57 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>