130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1669 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 642 aa  1275    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.98 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.85 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.26 
 
 		 374 aa  316  9e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.69 
 
 		 431 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.92 
 
 		 413 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.54 
 
 		 499 aa  243  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.68 
 
 		 415 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.8 
 
 		 404 aa  207  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.01 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.96 
 
 		 409 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  28.36 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.03 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  25.77 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.19 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.26 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.47 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  25.62 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.86 
 
 		 822 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  24.9 
 
 		 321 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.88 
 
 		 429 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  25.39 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  34.25 
 
 		 171 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  30.41 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.94 
 
 		 171 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  29.66 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  29.66 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  29.66 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  34.97 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  34.29 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 387 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  29.8 
 
 		 160 aa  63.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  34.97 
 
 		 175 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  33.08 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  36.44 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 		 171 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  32.58 
 
 		 168 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  32.69 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  32.67 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  32.05 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  29.8 
 
 		 146 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  37.86 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 319 aa  56.2  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  27.81 
 
 		 153 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  29.8 
 
 		 160 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 625 aa  55.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  29.65 
 
 		 188 aa  54.7  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 190 aa  54.7  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 190 aa  54.7  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  30.34 
 
 		 185 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 188 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 178 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2057  hypothetical protein  26.92 
 
 		 162 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 196 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2067  hypothetical protein  27.88 
 
 		 162 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 		 162 aa  52.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.41 
 
 		 167 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  36.11 
 
 		 167 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  30.34 
 
 		 171 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  27.21 
 
 		 184 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.03 
 
 		 181 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 251 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  27.21 
 
 		 184 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  27.21 
 
 		 184 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  34.09 
 
 		 219 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 271 aa  50.8  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.78 
 
 		 337 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  30.65 
 
 		 180 aa  50.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  33.64 
 
 		 208 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  29.66 
 
 		 158 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 221 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  25.61 
 
 		 184 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.05 
 
 		 302 aa  50.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.64 
 
 		 187 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.89 
 
 		 331 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.72 
 
 		 388 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.01 
 
 		 194 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  31.71 
 
 		 357 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.62 
 
 		 179 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.41 
 
 		 174 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 189 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  25.75 
 
 		 251 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 251 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  26.56 
 
 		 187 aa  48.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  31.65 
 
 		 355 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 251 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.27 
 
 		 376 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  27.4 
 
 		 166 aa  47.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 221 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.48 
 
 		 331 aa  47.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 		 160 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.41 
 
 		 165 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>