181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1602 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  48.57 
 
 		 843 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  48.08 
 
 		 869 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  49.35 
 
 		 844 aa  697    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  63.66 
 
 		 844 aa  932    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  63.53 
 
 		 839 aa  907    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  61.76 
 
 		 853 aa  913    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  46.43 
 
 		 870 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  63.9 
 
 		 843 aa  902    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  61.17 
 
 		 858 aa  909    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  64.64 
 
 		 857 aa  919    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  63.96 
 
 		 840 aa  862    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  68.82 
 
 		 856 aa  968    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  64.28 
 
 		 838 aa  909    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  49.65 
 
 		 844 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  64.87 
 
 		 857 aa  924    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  48.55 
 
 		 851 aa  631  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  46.36 
 
 		 860 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  46.01 
 
 		 861 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  41.82 
 
 		 832 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  48.95 
 
 		 869 aa  595  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  46.61 
 
 		 863 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  46.33 
 
 		 871 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  46.33 
 
 		 871 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  46.69 
 
 		 871 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  45.97 
 
 		 871 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  48.38 
 
 		 1108 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  48.38 
 
 		 880 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  45.5 
 
 		 871 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  48.21 
 
 		 883 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  46.18 
 
 		 834 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  43.41 
 
 		 840 aa  545  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  40.42 
 
 		 835 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  41.92 
 
 		 827 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  39.63 
 
 		 835 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  42.13 
 
 		 840 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  38.52 
 
 		 829 aa  505  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  41.56 
 
 		 831 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  40.71 
 
 		 826 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  36.48 
 
 		 838 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 830 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  36.05 
 
 		 838 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  36.92 
 
 		 832 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  37.01 
 
 		 832 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  37.72 
 
 		 833 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  37.28 
 
 		 830 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  39.5 
 
 		 835 aa  389  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1093  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  48.56 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0774  hypothetical protein  48.56 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  30.57 
 
 		 836 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  31.3 
 
 		 840 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  35.94 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 		 836 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  29.96 
 
 		 819 aa  360  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  30.37 
 
 		 842 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  32.45 
 
 		 828 aa  356  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  33.09 
 
 		 809 aa  353  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 809 aa  346  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  32.69 
 
 		 809 aa  345  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  35.02 
 
 		 828 aa  342  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  31.65 
 
 		 809 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  31.81 
 
 		 809 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  32.93 
 
 		 804 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  33.37 
 
 		 804 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 805 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  35.02 
 
 		 810 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  33 
 
 		 804 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  31.01 
 
 		 804 aa  328  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  33.13 
 
 		 804 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 804 aa  327  6e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  30.44 
 
 		 821 aa  327  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  32.51 
 
 		 804 aa  327  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  32.25 
 
 		 804 aa  326  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 804 aa  326  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  32.25 
 
 		 804 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  32.25 
 
 		 804 aa  325  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  32.92 
 
 		 810 aa  325  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 804 aa  324  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 		 804 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  33 
 
 		 804 aa  323  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  32.45 
 
 		 818 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  30.43 
 
 		 823 aa  320  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  31.58 
 
 		 833 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  35.96 
 
 		 838 aa  319  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  31.46 
 
 		 833 aa  317  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  31.35 
 
 		 833 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  34.51 
 
 		 829 aa  312  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  31.18 
 
 		 827 aa  307  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  28.88 
 
 		 823 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  29.02 
 
 		 815 aa  304  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  29.32 
 
 		 836 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  29.68 
 
 		 837 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  31.47 
 
 		 835 aa  300  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  30.88 
 
 		 816 aa  299  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  29.94 
 
 		 827 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  29.23 
 
 		 810 aa  298  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 842 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  29.11 
 
 		 842 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  30.41 
 
 		 817 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  30.03 
 
 		 831 aa  296  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>