More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1596 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
385 aa  777    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  69.87 
 
 
394 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.4 
 
 
372 aa  352  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.28 
 
 
373 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 
383 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 
385 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.86 
 
 
373 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.86 
 
 
382 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.36 
 
 
373 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  40.17 
 
 
493 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
700 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
700 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
489 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
700 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17340  intracellular sensory histidine protein kinase, two component  39.11 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
363 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
684 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
707 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
703 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
541 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
514 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
553 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
703 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
541 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  34.07 
 
 
797 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  45.75 
 
 
642 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 
642 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.63 
 
 
799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  47.97 
 
 
571 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  45.7 
 
 
649 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
494 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  46.39 
 
 
637 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 
619 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  35.48 
 
 
680 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  35.48 
 
 
680 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
394 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.68 
 
 
654 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
446 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
598 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.89 
 
 
438 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  34.22 
 
 
598 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
489 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
671 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
484 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
446 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  34.66 
 
 
687 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1334  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.71 
 
 
314 aa  123  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.1 
 
 
765 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
485 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  33.48 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
799 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
582 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  37.61 
 
 
582 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32.59 
 
 
1809 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  34.01 
 
 
740 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
596 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  33.73 
 
 
485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
595 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
801 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  37 
 
 
575 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  37 
 
 
575 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  37 
 
 
575 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
450 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  44.67 
 
 
700 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.43 
 
 
879 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 
650 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  34.67 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  44.53 
 
 
824 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.98 
 
 
683 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.17 
 
 
715 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.59 
 
 
459 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  29.29 
 
 
515 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
448 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.7 
 
 
715 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
1168 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
795 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  35.58 
 
 
356 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
748 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
795 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  31.58 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
795 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
692 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  34.96 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>