More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1473 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  766    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  60.43 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  61.68 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  61.04 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  59.02 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  48 
 
 		 389 aa  319  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  46.3 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  48.84 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  46.05 
 
 		 391 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  45.31 
 
 		 465 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  45.31 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  45.31 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  45.31 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  45.31 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  45.31 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  46.07 
 
 		 391 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  45.14 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  46.05 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  46.15 
 
 		 416 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  45.24 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  45.24 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  46.55 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  45.23 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  43.35 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  42.6 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  42.22 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  44.93 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  41.82 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  43.92 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  44.08 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  43.12 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  41.64 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  40.7 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  41 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  41.91 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  41.6 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  39.29 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  37.63 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  38.32 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  39.05 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  38.06 
 
 		 379 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  38.76 
 
 		 344 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  36.91 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  39.06 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  39.85 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  37.63 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  38.42 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  36.1 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  36.34 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  36.04 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  37.08 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  36.69 
 
 		 377 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  37.65 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  39.28 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  37.79 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  37.58 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  43.78 
 
 		 238 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  48.7 
 
 		 180 aa  140  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  33.63 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  44.14 
 
 		 231 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  40.22 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  39.78 
 
 		 285 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  34.81 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  35.62 
 
 		 164 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 		 180 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  42.66 
 
 		 190 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  42.44 
 
 		 301 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  36.08 
 
 		 194 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  38.89 
 
 		 231 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  46.26 
 
 		 178 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  35.12 
 
 		 199 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  41.94 
 
 		 181 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  37.66 
 
 		 159 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 199 aa  89.4  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  43.97 
 
 		 167 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  38.14 
 
 		 184 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  38.14 
 
 		 184 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  45 
 
 		 159 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  45 
 
 		 159 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  31.05 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  42.62 
 
 		 159 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  35.96 
 
 		 189 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  42.62 
 
 		 159 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  42.68 
 
 		 178 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  41.8 
 
 		 159 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  37.29 
 
 		 184 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  37.32 
 
 		 190 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  37.62 
 
 		 284 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  38.14 
 
 		 184 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  35.47 
 
 		 185 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  36.44 
 
 		 184 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  47.06 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>