More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1467 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  71.48 
 
 
271 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  69.02 
 
 
260 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  68.15 
 
 
260 aa  353  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  67.32 
 
 
260 aa  351  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  66.02 
 
 
270 aa  350  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.45 
 
 
266 aa  349  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  67.06 
 
 
260 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  66.8 
 
 
260 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  63.43 
 
 
268 aa  347  9e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  66.27 
 
 
269 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.35 
 
 
270 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  64.57 
 
 
270 aa  334  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  62.2 
 
 
270 aa  334  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  63.18 
 
 
265 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  63.18 
 
 
265 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  63.53 
 
 
270 aa  332  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  62.99 
 
 
270 aa  330  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  63.78 
 
 
272 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  63.39 
 
 
270 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.4 
 
 
271 aa  328  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  63.14 
 
 
275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  63.14 
 
 
265 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  61.33 
 
 
265 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  65.23 
 
 
270 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  61.81 
 
 
268 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  59.76 
 
 
285 aa  315  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.91 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.69 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  61.24 
 
 
283 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  61.24 
 
 
283 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  61.24 
 
 
283 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  59.6 
 
 
279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  57.2 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  57.2 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  57.63 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  58.04 
 
 
269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  56.69 
 
 
268 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  61.02 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  57.54 
 
 
272 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.63 
 
 
271 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  60.4 
 
 
270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  60 
 
 
273 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  60.55 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.24 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  63.05 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  61.18 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  61.18 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  61.18 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  60.32 
 
 
265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  58.66 
 
 
266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  60.08 
 
 
282 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.3 
 
 
286 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  60.16 
 
 
271 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56 
 
 
267 aa  298  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  55.91 
 
 
266 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.2 
 
 
267 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  57.42 
 
 
268 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  55.47 
 
 
267 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.47 
 
 
267 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  57.37 
 
 
268 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  55.69 
 
 
285 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  52.55 
 
 
266 aa  292  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  58.8 
 
 
272 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.91 
 
 
268 aa  292  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  55.69 
 
 
267 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  57.65 
 
 
273 aa  292  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  56.1 
 
 
267 aa  291  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.69 
 
 
267 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  54.8 
 
 
307 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.47 
 
 
267 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  54.47 
 
 
267 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  54 
 
 
278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  48.31 
 
 
280 aa  278  8e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  58.33 
 
 
280 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  52.63 
 
 
266 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  53.44 
 
 
267 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  52.76 
 
 
267 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  52.76 
 
 
267 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  51.97 
 
 
267 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.96 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.44 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  29.13 
 
 
263 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  29.13 
 
 
263 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.19 
 
 
291 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.57 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.66 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.99 
 
 
297 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.99 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.99 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.99 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.99 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  26.99 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  31.25 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  26.99 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.99 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.07 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.55 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.55 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  26.64 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>