17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1410 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  100 
 
 		 92 aa  184  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  58.23 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  56.58 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  61.43 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  49.35 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  57.75 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  53.52 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  56.34 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  53.52 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  51.32 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  50.67 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  54.17 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  51.35 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  52.86 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  38.03 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  34.65 
 
 		 321 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  36.49 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>