More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1383 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
339 aa  685    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  37.81 
 
 
352 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8495  glycosyl transferase family 2  39.54 
 
 
351 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
373 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
373 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 
324 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
338 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1054  hypothetical protein  35.51 
 
 
304 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.22 
 
 
337 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.22 
 
 
316 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
369 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
376 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 
235 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.74 
 
 
341 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
320 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
327 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.61 
 
 
312 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
274 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
280 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
363 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
318 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
322 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
703 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.26 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
302 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
289 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  24.66 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
372 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
727 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
597 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  22.04 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  27.38 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  26.34 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.78 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.91 
 
 
466 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
701 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  24.3 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.18 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.97 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
623 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  22.29 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
286 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
734 aa  76.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  27.6 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 
605 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>