157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1305 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  748    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  70.78 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  55.73 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  63.17 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  63.17 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  65.76 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  62.94 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  61.08 
 
 		 326 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  63.41 
 
 		 323 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  60.11 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  61.82 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  64.46 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  57.19 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  55.87 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  52.79 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  53.03 
 
 		 372 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  52.71 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  52.56 
 
 		 358 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  52.56 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  52.05 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  51.5 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  51.42 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  51.42 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  52.37 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  52.37 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  53.21 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  51.89 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  50.46 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  49.85 
 
 		 344 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  50.79 
 
 		 346 aa  288  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  49.24 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  49.24 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  49.24 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  49.24 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  49.24 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  49.24 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  49.24 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  46.47 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.89 
 
 		 325 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  43.32 
 
 		 321 aa  245  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  43.32 
 
 		 321 aa  245  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 		 324 aa  199  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  38.27 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  37.99 
 
 		 332 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  42.22 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  37.75 
 
 		 332 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  34.27 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  35.15 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  33.24 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  37.91 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  37.24 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  37.54 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  38.59 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  36.77 
 
 		 340 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  37.1 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  38.84 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 		 327 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  37.1 
 
 		 340 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 340 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  36.69 
 
 		 340 aa  176  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  37.1 
 
 		 340 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  36.77 
 
 		 340 aa  176  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  36.77 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  36.77 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  36.3 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  32.52 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 		 325 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 		 329 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  36.81 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  37.14 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  35.48 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  36.48 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 		 323 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 347 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  36.48 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  36.48 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  36.48 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  34.38 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  36.93 
 
 		 324 aa  169  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  35.53 
 
 		 327 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  34.17 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>