47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1283 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  63.92 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  62.6 
 
 		 278 aa  329  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  62.6 
 
 		 278 aa  329  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  62.6 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  58.43 
 
 		 277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  53.91 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  54.69 
 
 		 346 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  53.91 
 
 		 279 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  53.91 
 
 		 271 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  52.78 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  51.17 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  47.49 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  46.92 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  46.72 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  44.23 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  44.92 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  44.92 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  43.6 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  41.37 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  39.46 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  39.45 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  39.01 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  37.07 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  38.71 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  22.94 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  23.63 
 
 		 371 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 392 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  22.38 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0533  metallo-beta-lactamase family protein  37.25 
 
 		 52 aa  42.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000264713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  21.33 
 
 		 387 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 		 406 aa  42  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>