65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1267 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 171 aa  350  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  67.38 
 
 		 181 aa  204  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  66.43 
 
 		 164 aa  200  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  57.58 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  59.74 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  55.15 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  57.89 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  60.96 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  49.69 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  49.06 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  56.88 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  53.57 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  55.45 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  52.46 
 
 		 272 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  56.88 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  50.79 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  50.39 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  42.33 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  42.42 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  50.41 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  50.41 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  50.41 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  48.03 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  46.72 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  40.96 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  40.96 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  42.86 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  49.58 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  49.58 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  47.54 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  42.06 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  42.06 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  41.55 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  41.21 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  43.09 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  41.38 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  45.45 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  43.36 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  36.67 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  34.74 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  35.26 
 
 		 205 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  33.57 
 
 		 177 aa  84  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  31.94 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  35.11 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  33.15 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  37.27 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  33.09 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.37 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  34.86 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  33.12 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  26.7 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  28.8 
 
 		 534 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  24.19 
 
 		 241 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  32.65 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  28.42 
 
 		 466 aa  44.7  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.93 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  29.84 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  23.85 
 
 		 505 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  23.42 
 
 		 287 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  31.71 
 
 		 526 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  25 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  26.56 
 
 		 669 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>