113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1035 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 163 aa  326  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 163 aa  326  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  99.39 
 
 		 163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  49.66 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  48.28 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  49.26 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  47.24 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  47.24 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  41.29 
 
 		 174 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  41.29 
 
 		 174 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  44.53 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  45.68 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  42.75 
 
 		 147 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  43.56 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  44.85 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  44.85 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  44.85 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2333  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1428  hypothetical protein  44.16 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3828  hypothetical protein  44.16 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.73032 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  44.74 
 
 		 193 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  39.76 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  45.68 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  39.63 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  39.63 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  39.63 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  39.63 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  41.22 
 
 		 145 aa  97.1  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  36.81 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  40.61 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  40.61 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  40.61 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  40.61 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  40.61 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  40.61 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  40.61 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  46.26 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  34.97 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  34.15 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  34.15 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  43.14 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  42.55 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2501  hypothetical protein  33.78 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2336  transposase IS3/IS911 family protein  31.9 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  35.85 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1699  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000451085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0650  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.124888  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  29.09 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  29.09 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>