130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1032 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  63.89 
 
 
283 aa  362  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  58.54 
 
 
294 aa  326  2e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  58.08 
 
 
279 aa  326  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  60.21 
 
 
282 aa  324  8e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  58.19 
 
 
278 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  57.05 
 
 
286 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  57.84 
 
 
278 aa  314  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  60.7 
 
 
265 aa  307  2e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  62.3 
 
 
285 aa  292  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  52.65 
 
 
277 aa  282  4e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  52.65 
 
 
277 aa  282  5e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  51.24 
 
 
283 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  54.31 
 
 
255 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  52.5 
 
 
307 aa  273  2e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  50.53 
 
 
281 aa  272  5e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  52.11 
 
 
278 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  48.77 
 
 
271 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  49.12 
 
 
270 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  48.77 
 
 
270 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  48.41 
 
 
268 aa  262  5e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  48.41 
 
 
268 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  48.41 
 
 
268 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  52.12 
 
 
249 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  48.06 
 
 
268 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  47.7 
 
 
268 aa  259  5e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  49.65 
 
 
338 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  49.65 
 
 
272 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  49.65 
 
 
272 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  50 
 
 
250 aa  258  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  49.65 
 
 
272 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  47.7 
 
 
268 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  49.65 
 
 
301 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  54.61 
 
 
320 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  53.39 
 
 
250 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  53.39 
 
 
250 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  53.39 
 
 
250 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  45.23 
 
 
271 aa  213  4e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  48.47 
 
 
256 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  45.18 
 
 
249 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  40.17 
 
 
277 aa  182  5e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  39.34 
 
 
251 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  38.93 
 
 
251 aa  180  3e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  43.86 
 
 
258 aa  179  6e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  43.86 
 
 
258 aa  179  6e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  39.74 
 
 
251 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  40.53 
 
 
251 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  41.36 
 
 
251 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  37.85 
 
 
252 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.84 
 
 
243 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  40.09 
 
 
251 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  42.79 
 
 
253 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  40.91 
 
 
251 aa  173  4e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  40.91 
 
 
251 aa  172  4e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  40.91 
 
 
251 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  38.91 
 
 
258 aa  172  8e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  38.82 
 
 
256 aa  166  3e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  38.74 
 
 
287 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  40.93 
 
 
271 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  38.02 
 
 
283 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.84 
 
 
277 aa  155  5e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.84 
 
 
277 aa  155  5e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.84 
 
 
277 aa  155  5e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  36.55 
 
 
258 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  36.72 
 
 
261 aa  145  8e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.04 
 
 
253 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  35.98 
 
 
267 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  34.44 
 
 
291 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  30.52 
 
 
266 aa  128  9e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  35.98 
 
 
246 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.06572e-06  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  32.96 
 
 
316 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.73 
 
 
258 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.43 
 
 
261 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  34.87 
 
 
384 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  32.76 
 
 
321 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  32.61 
 
 
337 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.79 
 
 
261 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  31.14 
 
 
337 aa  119  8e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  32.46 
 
 
288 aa  118  1e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  7.83609e-05  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  32.79 
 
 
261 aa  118  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  33.89 
 
 
265 aa  117  2e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  35.71 
 
 
304 aa  117  2e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  116  4e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  32.02 
 
 
281 aa  116  4e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  34.53 
 
 
305 aa  115  7e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  32.41 
 
 
297 aa  115  8e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  32.81 
 
 
291 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  33.99 
 
 
315 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  33.33 
 
 
270 aa  113  4e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 
258 aa  113  4e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  32.02 
 
 
291 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.98 
 
 
266 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  30.53 
 
 
341 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  30.07 
 
 
332 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  30.88 
 
 
332 aa  108  7e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  32.38 
 
 
281 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  31.32 
 
 
332 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  32.09 
 
 
332 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.53 
 
 
292 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  32.17 
 
 
332 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>