95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1021 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 490 aa  900    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  35.21 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  34.58 
 
 		 579 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  35.51 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  35.51 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  33.65 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  34.58 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  34.91 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  46.27 
 
 		 717 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  46.27 
 
 		 702 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  46.27 
 
 		 718 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  46.27 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  37.38 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  32.61 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  32.61 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  31.44 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  35.9 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  34.53 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1437  flagellar hook-length control protein  30.7 
 
 		 650 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  31.17 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  36.26 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  36.26 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  41.79 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  34.52 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  39.53 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  35.29 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  34.58 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  38.37 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  35.56 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  35.29 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  39.53 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  39.53 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  39.53 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  39.53 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  42.42 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3775  flagellar hook-length control protein  38.37 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  39.53 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  38.37 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  41.89 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  35.56 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4173  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  33.33 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  30.67 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  38.37 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  32.56 
 
 		 485 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  27.82 
 
 		 580 aa  57  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  33.98 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  33.98 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1241  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.896281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1699  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0151155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2176  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000764801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2043  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.436184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  41.03 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  30.08 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  36.05 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3066  flagellar hook-length control protein  37.93 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3088  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1973  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  34.19 
 
 		 609 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  32.89 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  32.94 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  35.56 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  31.19 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  36.05 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5266  flagellar hook-length control protein  35.16 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.265097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  32.93 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  39.06 
 
 		 480 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  34.09 
 
 		 516 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  32.32 
 
 		 504 aa  50.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5102  flagellar hook-length control protein  38.81 
 
 		 487 aa  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  30.26 
 
 		 623 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  40.28 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  29.17 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4390  flagellar hook-length control protein  29.11 
 
 		 477 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3802  flagellar hook-length control protein  32.1 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  31.65 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3076  flagellar hook-length control protein  32.69 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  33.87 
 
 		 369 aa  47  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0555  flagellar hook-length control protein  36.99 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  30.36 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0643  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4095  flagellar hook-length control protein  32.76 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  31.73 
 
 		 567 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  28 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  29.89 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  28 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>