179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1008 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 672 aa  1339    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 700 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  38.72 
 
 		 654 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1085 aa  316  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1094 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 3560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  40.08 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 		 667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 3035 aa  301  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 616 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 740 aa  296  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 4489 aa  290  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 611 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  44.68 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  35.48 
 
 		 568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  39.2 
 
 		 569 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 732 aa  283  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 618 aa  280  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  38.83 
 
 		 492 aa  276  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  41.73 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  40 
 
 		 637 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 647 aa  270  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  38.17 
 
 		 566 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.22 
 
 		 570 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  40.17 
 
 		 632 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  35.62 
 
 		 657 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 750 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  34.56 
 
 		 657 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  45.31 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  34.65 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  45 
 
 		 590 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 761 aa  251  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  37.47 
 
 		 633 aa  250  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  31.46 
 
 		 624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 909 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.19 
 
 		 816 aa  230  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 750 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  37.43 
 
 		 588 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  35.08 
 
 		 680 aa  223  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  35.99 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.76 
 
 		 630 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 739 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1714 aa  217  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  40.07 
 
 		 295 aa  217  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  33.52 
 
 		 395 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 808 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.65 
 
 		 1106 aa  201  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.63 
 
 		 589 aa  198  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 968 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  30.13 
 
 		 719 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 		 699 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  34.78 
 
 		 585 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 739 aa  187  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 1143 aa  186  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 821 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 776 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 708 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.07 
 
 		 780 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 780 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 821 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 		 789 aa  180  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 776 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 776 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 776 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.12 
 
 		 797 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 		 745 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 776 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 		 790 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 		 1106 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.98 
 
 		 529 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 734 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 789 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.56 
 
 		 589 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 738 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 779 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  34.1 
 
 		 553 aa  174  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 739 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 		 717 aa  173  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  28.88 
 
 		 1596 aa  171  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 717 aa  170  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  28.22 
 
 		 740 aa  170  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 790 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  29.56 
 
 		 747 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 754 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.97 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 633 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 598 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.45 
 
 		 1116 aa  167  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 647 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  32.25 
 
 		 937 aa  165  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  29.44 
 
 		 731 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 627 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  29.44 
 
 		 731 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 828 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.23 
 
 		 781 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 718 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 793 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>