More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0901 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 215 aa  234  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  53.99 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  53.52 
 
 		 215 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  53.52 
 
 		 215 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  53.52 
 
 		 215 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.55 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 214 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 215 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 215 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 215 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 215 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 215 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 215 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 215 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 282 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  49.77 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 214 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 215 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 214 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  49.3 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 209 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.89 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  44.44 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  44.93 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  44.93 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  42.51 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 455 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 218 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.27 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  41.15 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>