More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0887 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0887  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.9 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.5 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  28.45 
 
 		 239 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  28.45 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  28.45 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  28.45 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  28.45 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  26.69 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 290 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 290 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  31.43 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.6 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  30.42 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.28 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.66 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  23.29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  23.29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  23.6 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  24.78 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  23.29 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  24.78 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>