More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0750 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  56.75 
 
 		 1277 aa  1393    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  67 
 
 		 1308 aa  1715    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  72.23 
 
 		 1345 aa  1932    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.82 
 
 		 1344 aa  1917    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  76.17 
 
 		 1307 aa  2055    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  70.63 
 
 		 1342 aa  1923    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.9 
 
 		 1218 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  70.78 
 
 		 1342 aa  1925    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  71.86 
 
 		 1345 aa  1934    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  70.78 
 
 		 1342 aa  1925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  65.14 
 
 		 1291 aa  1705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  72.5 
 
 		 1324 aa  1971    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  55.99 
 
 		 1280 aa  1484    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.99 
 
 		 1292 aa  1998    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  65.79 
 
 		 1259 aa  1681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  69.04 
 
 		 1279 aa  1845    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  37.94 
 
 		 1202 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  70.78 
 
 		 1342 aa  1926    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.89 
 
 		 1304 aa  2108    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  80.08 
 
 		 1292 aa  2142    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  70.78 
 
 		 1342 aa  1925    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  70.78 
 
 		 1341 aa  1917    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  37.39 
 
 		 1217 aa  742    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  37.51 
 
 		 1214 aa  762    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.4 
 
 		 1307 aa  2059    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.16 
 
 		 1304 aa  2120    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  65.05 
 
 		 1292 aa  1687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  72.01 
 
 		 1345 aa  1939    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.45 
 
 		 1371 aa  1901    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  70.56 
 
 		 1359 aa  1903    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  36.12 
 
 		 1212 aa  721    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  36.42 
 
 		 1213 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.9 
 
 		 1289 aa  1479    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.21 
 
 		 1227 aa  737    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  78.29 
 
 		 1307 aa  2111    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  81.88 
 
 		 1308 aa  2164    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  63.59 
 
 		 1271 aa  1654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  70.78 
 
 		 1342 aa  1926    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  80.12 
 
 		 1300 aa  2145    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  36.04 
 
 		 1212 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  70.79 
 
 		 1349 aa  1936    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.36 
 
 		 1265 aa  2082    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  70.78 
 
 		 1342 aa  1925    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  72.42 
 
 		 1324 aa  1968    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  70.25 
 
 		 1364 aa  1941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  56.75 
 
 		 1277 aa  1393    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  71.05 
 
 		 1341 aa  1914    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.93 
 
 		 1210 aa  751    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  38.15 
 
 		 1218 aa  761    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.44 
 
 		 1286 aa  1417    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.05 
 
 		 1341 aa  1914    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.82 
 
 		 1288 aa  1464    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 1309 aa  2697    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.03 
 
 		 1340 aa  1917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.17 
 
 		 1279 aa  1855    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.05 
 
 		 1341 aa  1914    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  37.68 
 
 		 1221 aa  763    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.52 
 
 		 1282 aa  1364    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.88 
 
 		 1340 aa  1913    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 		 1183 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  31.51 
 
 		 1188 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  31.69 
 
 		 1183 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 1187 aa  483  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.55 
 
 		 1197 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  33.13 
 
 		 1204 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.94 
 
 		 459 aa  105  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  25.11 
 
 		 430 aa  103  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  26.4 
 
 		 472 aa  102  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  26.4 
 
 		 472 aa  101  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.71 
 
 		 418 aa  100  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.23 
 
 		 459 aa  98.6  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.8 
 
 		 469 aa  97.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  26.4 
 
 		 473 aa  97.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  25.89 
 
 		 473 aa  97.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.89 
 
 		 473 aa  97.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.75 
 
 		 456 aa  96.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.12 
 
 		 434 aa  95.5  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.79 
 
 		 411 aa  94.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 472 aa  94.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.89 
 
 		 473 aa  93.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.4 
 
 		 473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  23.62 
 
 		 952 aa  92.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  26.33 
 
 		 473 aa  91.7  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.24 
 
 		 460 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.15 
 
 		 413 aa  90.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.24 
 
 		 460 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  26.33 
 
 		 473 aa  90.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.84 
 
 		 460 aa  89.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  26.33 
 
 		 473 aa  90.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  26.33 
 
 		 473 aa  90.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  26.33 
 
 		 473 aa  90.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  25.28 
 
 		 431 aa  89.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  26.33 
 
 		 473 aa  90.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.81 
 
 		 479 aa  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  26.08 
 
 		 524 aa  89  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  26.08 
 
 		 473 aa  88.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.81 
 
 		 479 aa  87.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.31 
 
 		 722 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  22.86 
 
 		 425 aa  87.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>