More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0487 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 566 aa  1146    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34.18 
 
 		 550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  33.27 
 
 		 525 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 481 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.13 
 
 		 733 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  41.87 
 
 		 360 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 740 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1827 aa  226  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 3145 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 608 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 681 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 637 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 611 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.03 
 
 		 503 aa  200  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 615 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 612 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 601 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 689 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1450 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 955 aa  194  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  29.7 
 
 		 703 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28.96 
 
 		 648 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.05 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.28 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 578 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 620 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 583 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 		 614 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 614 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 		 614 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 		 626 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 688 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 767 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 607 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 1034 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 935 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 		 614 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 639 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 653 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 637 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.18 
 
 		 653 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 		 614 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.53 
 
 		 603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 714 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.94 
 
 		 626 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1005 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 747 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 547 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 542 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 662 aa  176  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 714 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 636 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 611 aa  173  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 635 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 574 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 635 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.09 
 
 		 1677 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  30.22 
 
 		 872 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1038 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 1212 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  28.85 
 
 		 705 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 		 615 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 604 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 559 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  30.35 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 646 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  29.96 
 
 		 546 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 545 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 923 aa  160  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 545 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 558 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 536 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.64 
 
 		 1764 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  27.96 
 
 		 577 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  29.4 
 
 		 598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  29.4 
 
 		 711 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 598 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 747 aa  150  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 760 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 593 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>