More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0478 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 146 aa  286  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  69.44 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  48.91 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  48.91 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  48.91 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  48.91 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  48.91 
 
 		 176 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.21 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.52 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.91 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.48 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.91 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  46.72 
 
 		 172 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.1 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.53 
 
 		 178 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.15 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.15 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.15 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  45.26 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.38 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.03 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3920  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.96 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0757  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.45 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.19 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  44.6 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.19 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.58 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3268  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.24 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  43.33 
 
 		 167 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.37 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.43 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4551  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.11 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0410  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.24 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.52 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.44 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6005  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.62 
 
 		 159 aa  105  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.76 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.31 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  38.73 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.31 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.31 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.31 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.31 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.31 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.52 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.06 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  38.28 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  35.43 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  40.15 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  38.71 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  37.9 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.21 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  40.8 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.3 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  39.52 
 
 		 139 aa  96.7  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  40.8 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.85 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  39.53 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  39.52 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.03 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  34.06 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  36.8 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.76 
 
 		 136 aa  94  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  42.75 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  40 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  38.71 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>