More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0370 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0370  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 		 248 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0301  putative transmembrane protein  52.24 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.903385  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  48.51 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  39.15 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  39.83 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3846  peptidase M22, glycoprotease  43.5 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  38.72 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4459  peptidase M22, glycoprotease  45.27 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293855  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  46.44 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  46.44 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  43.4 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  38.91 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  35.47 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  35.53 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0189  peptidase M22, glycoprotease  40.08 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  42.8 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  40.74 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  37.89 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  38.98 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  38.56 
 
 		 236 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  33.33 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  37.99 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.9 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  35.9 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  35.9 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4621  peptidase M22, glycoprotease  44.58 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  37.99 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  38.26 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.32 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  38.14 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  38.26 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  38.26 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  40.82 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  40.23 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  38.87 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  40.23 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  40.64 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  36.56 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  37.72 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  35.34 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  39.85 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4569  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  38.46 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  43.98 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  40.96 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  39.02 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  33.48 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  34.48 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  36.29 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  39.08 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  39.08 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  40.23 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  38.7 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  51.56 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  40.17 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  33.48 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  45.34 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  37.07 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  31.9 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  44.06 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  40.27 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5354  peptidase M22, glycoprotease  38.7 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  39.68 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  42.92 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  34.2 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  34.2 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  39.08 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  34.2 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  38.63 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  38.2 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  34.2 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  34.2 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  38.49 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  38.02 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  37.17 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  37.44 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  36.82 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  43.38 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  32.9 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  38.85 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  38.05 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  38.85 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  37.34 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  38.37 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  39.24 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  38.37 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  38.37 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  36.52 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  37.77 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  31.25 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  37.45 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  30.13 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  39.13 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  40.6 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  31.6 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  31.6 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  31.6 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>