178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0353 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  100 
 
 
259 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  56.63 
 
 
267 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  57.48 
 
 
249 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  57.48 
 
 
249 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  52.36 
 
 
288 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  55.51 
 
 
287 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  55.83 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  53.55 
 
 
249 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  52.63 
 
 
255 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  49.34 
 
 
246 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  46.47 
 
 
264 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  48.31 
 
 
265 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  48.31 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  41.3 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  44.6 
 
 
276 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  44.24 
 
 
251 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  44.24 
 
 
272 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  44.24 
 
 
272 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  43.69 
 
 
251 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  43.32 
 
 
251 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  44.24 
 
 
251 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  43.78 
 
 
251 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  41.7 
 
 
241 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  43.04 
 
 
248 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  43.22 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  43.22 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  43.22 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  43.22 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  43.22 
 
 
249 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  43.22 
 
 
249 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  43.22 
 
 
249 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  43.22 
 
 
249 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  43.22 
 
 
251 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  44 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  34.91 
 
 
234 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  34.23 
 
 
228 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  34.53 
 
 
234 aa  115  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  36.55 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  35.78 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  31.53 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  33.18 
 
 
240 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  35.19 
 
 
228 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  32.26 
 
 
244 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  35.32 
 
 
247 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  34.09 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  34.78 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  32.16 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  26.58 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  31.31 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  33.8 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  31.37 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  33.9 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  33.48 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  27.51 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  30.49 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  27.07 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  30.97 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  27.73 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  28.5 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  33.48 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  27.23 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  31.22 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  27.49 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  31.06 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  28.3 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.17 
 
 
235 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.17 
 
 
235 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  26.82 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  26.36 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  26.36 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  26.36 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  28.37 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  33.08 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.36 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  31.25 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.8 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  33.48 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  31.28 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  33.48 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  33.8 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  34.78 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  32.59 
 
 
243 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  33.33 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  29.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  23.63 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  32.69 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  34.62 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  34.62 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  26.96 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.69 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.63 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.46 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.03 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  28.19 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.27 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  27.75 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.35 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.35 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.35 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.35 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>