187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0261 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  60.09 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  61.03 
 
 		 220 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  61.9 
 
 		 232 aa  258  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  61.03 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  58.14 
 
 		 221 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  61.68 
 
 		 228 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  59.05 
 
 		 212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  60.48 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  55.4 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  53.99 
 
 		 215 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  53.05 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  53.77 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  53.99 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  52.83 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  57.55 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  53.05 
 
 		 217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  48.1 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  48.57 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  51.89 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  45.93 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  47.85 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  40.95 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  41.04 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.15 
 
 		 219 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  40.47 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  38.68 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  39.34 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  36.02 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  38.39 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  37.26 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  38.39 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  39.34 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  35.55 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  38.79 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  35.55 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  38.6 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  38.14 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  38.6 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  38.6 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  38.6 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  36.28 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  36.15 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  37.79 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  33.02 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  38.68 
 
 		 237 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.82 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  33.18 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  28.44 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  33.97 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.11 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>