33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0222 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  963    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  64.4 
 
 		 481 aa  627  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  63.11 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  65.85 
 
 		 484 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  61.89 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  62.3 
 
 		 480 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  65.45 
 
 		 484 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  61.32 
 
 		 482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  61.6 
 
 		 483 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  61.52 
 
 		 481 aa  569  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  56.3 
 
 		 510 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  55.89 
 
 		 494 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  55.74 
 
 		 478 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  51.43 
 
 		 486 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  50.71 
 
 		 510 aa  458  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  65.8 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  51.46 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  31.49 
 
 		 489 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  48.3 
 
 		 176 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  29.07 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  29.69 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  27.61 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  27.99 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  27.18 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  28.51 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  22.66 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  28.46 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  27.25 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  25.26 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  28.42 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  25.42 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  24.23 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.37 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>