59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0219 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  59.69 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  59.9 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  56.25 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  56.77 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  54.87 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.68 
 
 		 195 aa  208  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  54.6 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.36 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  44.92 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.12 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.56 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.02 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.8 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  36.9 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  35.83 
 
 		 437 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  36.65 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  27.27 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  28.49 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  29.44 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.67 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.28 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.1 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  28.75 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  30.81 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  28.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  26.97 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  25.95 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  27.32 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  36.84 
 
 		 307 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  24.72 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.44 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  25.87 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  31.08 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  25.32 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.77 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  24.82 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.18 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.19 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  22.93 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.2 
 
 		 747 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.22 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  25.95 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  23.75 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.33 
 
 		 316 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 216 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.568645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>