34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0105 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0105  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0223  hypothetical protein  42.62 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0180  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3734  hypothetical protein  47.54 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0151275  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0202  hypothetical protein  47.54 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0550  hypothetical protein  49.21 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4223  hypothetical protein  46.03 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0515  hypothetical protein  47.62 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0499  hypothetical protein  47.62 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2896  hypothetical protein  44.26 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0750135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1253  hypothetical protein  49.21 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0981  hypothetical protein  46.03 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4136  hypothetical protein  43.75 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2976  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2362  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2996  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6325  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.999223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0295  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382928  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3023  hypothetical protein  37.7 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2886  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2971  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3385  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000135899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0524  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.523411  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2249  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0344  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0331  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2035  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3058  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  44.44 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  39.66 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2776  hypothetical protein  47.22 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1467  hypothetical protein  44.44 
 
 		 98 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>