160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0104 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  69.7 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  60.43 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  60.22 
 
 		 376 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  61.64 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  58.54 
 
 		 360 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  60.66 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  54.62 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  59.56 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  59.31 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  59.08 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  52.36 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  52.09 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  52.97 
 
 		 397 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  51.74 
 
 		 396 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  51.99 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  50.5 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  51.74 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  51.74 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  51.74 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  51.74 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  51.74 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  51.74 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  51.74 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  51.24 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  51.24 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  50.87 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  50.5 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  51.75 
 
 		 396 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  50 
 
 		 400 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  48.96 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  47.96 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  47.7 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  48.38 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  45.55 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  47.19 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  42.75 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  44.47 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  44.47 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  42.13 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  44.5 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  40.63 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  40.37 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  39.51 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  39.52 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  38.84 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  38.84 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  42.67 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  38.59 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  41.24 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  38.35 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  39.7 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  40.85 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  40.85 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  36.73 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  37.16 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.17 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  32.2 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  29.36 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  32.62 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  36.16 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  29.92 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  30.5 
 
 		 386 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.07 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.93 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.84 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  32.04 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  33.24 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  31.08 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  27.14 
 
 		 397 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  31.35 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.89 
 
 		 377 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.34 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.29 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  32.37 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.02 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.55 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  33.06 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  29.92 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  32.41 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  37.27 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  35.6 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  27.22 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  27.84 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  32.44 
 
 		 366 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  25.53 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  29.94 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  25.37 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  25.47 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  31.43 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  29.64 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  27.79 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  31.88 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  30.75 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  33.79 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  34.9 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  31.97 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  25.24 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  32.59 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  29.73 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>