95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0091 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  418  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  49 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  51.47 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  49.5 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  50.49 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  49.74 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  31.15 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  40.74 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  41.18 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  38.14 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  43.24 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  41.92 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  40.41 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  40.74 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  36.13 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  33.17 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  36.02 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  32.43 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  40.54 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  43.2 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  38.81 
 
 		 200 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  34.57 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  31.76 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  30.69 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  37.37 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  37.04 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  32.82 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  34.04 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  34.95 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  33.88 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  36.41 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  38.66 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  34.57 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  39.64 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  40.12 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  33.68 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  39.69 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  38.22 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  37.43 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  31.33 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  34.39 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  38.37 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  32.54 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  36.59 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  31.47 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  35.2 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  34.15 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  31.82 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  31.33 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  30.81 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  31.63 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  30.3 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  28.72 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  29.44 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  27.72 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.52 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  26.92 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  28.19 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  27.27 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  26.76 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  27.66 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  21.89 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  27.13 
 
 		 254 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  27.13 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  22.96 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  30.89 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  29.53 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  30.56 
 
 		 156 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  26.63 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  26.25 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  27.75 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  30.05 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  29.69 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  23.84 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  24.56 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  32.73 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  21.59 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  25.31 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  25.26 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  27.03 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  22.56 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  26.4 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  27.51 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  32.12 
 
 		 201 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  27.81 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>