More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0089 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0619  putative potassium transport flavoprotein  71.5 
 
 		 611 aa  879    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  65.16 
 
 		 600 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0787  hypothetical protein  61.46 
 
 		 610 aa  750    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0126  hypothetical protein  59.71 
 
 		 567 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.622475  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  65.25 
 
 		 600 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  63.26 
 
 		 600 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0089  putative potassium transport flavoprotein  100 
 
 		 602 aa  1249    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00322224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2977  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  64.5 
 
 		 607 aa  795    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  65.08 
 
 		 600 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1943  flavin-containing monooxygenase, putative  59.97 
 
 		 615 aa  701    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  67.08 
 
 		 600 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2511  putative monooxygenase protein  64.87 
 
 		 600 aa  798    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  63.26 
 
 		 607 aa  772    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3171  flavin-containing monooxygenase FMO  67.36 
 
 		 600 aa  794    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2961  putative potassium transport flavoprotein  67 
 
 		 600 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4157  monooxygenase protein, putative  64.68 
 
 		 599 aa  744    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316237  normal  0.900537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3024  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  72.77 
 
 		 600 aa  876    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0624  hypothetical protein  60.8 
 
 		 633 aa  737    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0617  hypothetical protein  60.8 
 
 		 612 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  64.14 
 
 		 607 aa  773    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  62.2 
 
 		 603 aa  754    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0879  flavin-containing monooxygenase FMO  67.28 
 
 		 596 aa  824    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.22 
 
 		 620 aa  709    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1896  putative potassium transport flavoprotein  67.01 
 
 		 609 aa  832    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0076  putative potassium transport flavoprotein  78.22 
 
 		 600 aa  962    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0637  hypothetical protein  60.8 
 
 		 633 aa  737    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  65.21 
 
 		 600 aa  795    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  66.95 
 
 		 598 aa  842    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  50.7 
 
 		 573 aa  566  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  41.46 
 
 		 614 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  38.67 
 
 		 629 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0641774 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  34.6 
 
 		 640 aa  382  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01129  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 		 556 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00253051  normal  0.734558 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11089  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11650)  34.6 
 
 		 624 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00144907  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  35.23 
 
 		 601 aa  333  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  33.17 
 
 		 648 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 610 aa  277  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  30.63 
 
 		 637 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  27.06 
 
 		 378 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4542  putative flavoprotein involved in K+ transport  34.18 
 
 		 207 aa  122  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.61 
 
 		 378 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.95 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  31.13 
 
 		 656 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.81 
 
 		 399 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  25.68 
 
 		 650 aa  91.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2012  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 651 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00586  conserved hypothetical protein  25.21 
 
 		 536 aa  90.1  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.793927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.82 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.11 
 
 		 377 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  25.26 
 
 		 407 aa  88.2  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.07 
 
 		 495 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  25.21 
 
 		 491 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  29.51 
 
 		 347 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 642 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 642 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  28.38 
 
 		 347 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  25.57 
 
 		 489 aa  87.4  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  28.96 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  29.17 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  29.17 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  29.17 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  28.1 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  29.17 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  25.41 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 382 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.48 
 
 		 348 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  28.93 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.58 
 
 		 816 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.45 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  28.5 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  28.5 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.5 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  28.12 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  28.42 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  22.86 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.07 
 
 		 816 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  23.45 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  28.3 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  24.26 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.74 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  25.69 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  28.8 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  30.1 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  28.44 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.91 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2826  hypothetical protein  25.06 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0123091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2870  hypothetical protein  25.06 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.38934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2855  hypothetical protein  25.06 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.189256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.7 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.85 
 
 		 818 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  28.36 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  29.38 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  24.32 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.85 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.88 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.88 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.79 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>