More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0072 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  100 
 
 		 233 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  61.05 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  61.75 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  61.8 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  51.55 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  56.35 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  58.64 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  53.92 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  56.41 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  58.12 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  55.5 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  56.98 
 
 		 196 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  46.91 
 
 		 185 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  50.79 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  50.79 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  40.32 
 
 		 187 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  46.35 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  38.37 
 
 		 178 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  46.02 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  40.76 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.66 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  38.76 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  43.6 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  40.35 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  43.98 
 
 		 199 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  42.14 
 
 		 188 aa  92  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  43.35 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  39.88 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  44.59 
 
 		 199 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  44.59 
 
 		 199 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  44.59 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  41.88 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  43.95 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  43.95 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  43.95 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  37.24 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  39.56 
 
 		 361 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  44.86 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  42.77 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  43.93 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  43.93 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  37.57 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  42.57 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  35.86 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  44.51 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  33.75 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  36.99 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  34.41 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  27.65 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  32.43 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.75 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  31.75 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  31.75 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.34 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  31.75 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  31.75 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  35.43 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  33.82 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  33.82 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.55 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  38.05 
 
 		 396 aa  72  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  38.12 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  35.66 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  30.65 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  33.14 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.89 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  34.19 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.17 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.52 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.13 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  31.54 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  40.19 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  27.66 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.66 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.39 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.09 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.09 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  39.37 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.51 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.57 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  36.48 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  35.4 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  36.48 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  36.48 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.63 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  29.95 
 
 		 463 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  34.51 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.88 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  28.79 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  29.41 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.69 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  29.35 
 
 		 431 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.07 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  32.47 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  31.85 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  31.05 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  33.57 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  31.67 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  32.5 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>