153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0071 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  100 
 
 		 199 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  57.43 
 
 		 194 aa  204  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  57.23 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  55.85 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  57.37 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  58.29 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  58.29 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  50.28 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  54.4 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  54.91 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  40.56 
 
 		 175 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  40.56 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  40.56 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  40.56 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  40.56 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  39.44 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  37.43 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  47.34 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  38.67 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  39.06 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  36.7 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  36.17 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  37.43 
 
 		 181 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  39.44 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  34.95 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  36.97 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  36.97 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  36.97 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  36.97 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  36.97 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  36.97 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  38.89 
 
 		 176 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  37.58 
 
 		 176 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  35.75 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  40.71 
 
 		 176 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  34.55 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  35.29 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  39.29 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  40 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  36.03 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  36.76 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  35.39 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  34.97 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  30.6 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  32.6 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  34.91 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  33.76 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  35.97 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  33.14 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  35.25 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  31.87 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  38.69 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.25 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  32 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  23.66 
 
 		 420 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  26.84 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  24.31 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  24.82 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  27.69 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  25.53 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  26.09 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  25.52 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  28.22 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  26.62 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  26.62 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  26.62 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.63 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  23.68 
 
 		 416 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  27.34 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  27.34 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  25.34 
 
 		 392 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  26.67 
 
 		 401 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  25.85 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.21 
 
 		 390 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  25.9 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  28.79 
 
 		 401 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.67 
 
 		 395 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  27.78 
 
 		 401 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  24.49 
 
 		 390 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  24.49 
 
 		 390 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  24.49 
 
 		 390 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.49 
 
 		 415 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.64 
 
 		 395 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  21.9 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  25.33 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.56 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.22 
 
 		 392 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  26.62 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  23.91 
 
 		 393 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  27.03 
 
 		 385 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  27.89 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  30.34 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.6 
 
 		 387 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  26.52 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.03 
 
 		 387 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  29.66 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  31.21 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  33.58 
 
 		 401 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  39.62 
 
 		 393 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  27.13 
 
 		 450 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>