61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0064 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  63.21 
 
 		 106 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  59.43 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  45.71 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.71 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.13 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  41 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  43 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  42 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  40 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  40 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  39.78 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  36.56 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  38.2 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.96 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  28.3 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  28.3 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.61 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  32.61 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.18 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.18 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.37 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.03 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.22 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  32.22 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.85 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.18 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.35 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  32.1 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.77 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  29.07 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  27.47 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  28.89 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  26.8 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.77 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  27.78 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  28.05 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  26.88 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.18 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.58 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  23.86 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  29.47 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.78 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  22.22 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.29 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  26.74 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  27.06 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  26.67 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  26.67 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.06 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.44 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.44 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  29.21 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  35.09 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  25.53 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.76 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  21.92 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.42 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>