More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0041 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  81.75 
 
 		 403 aa  694    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  78.25 
 
 		 404 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  85.15 
 
 		 404 aa  711    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 404 aa  828    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  80.25 
 
 		 402 aa  680    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  85.86 
 
 		 406 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  66.67 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  47.33 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  41.07 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  37.62 
 
 		 407 aa  252  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  37.65 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.75 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  41.16 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  37.32 
 
 		 420 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  37.32 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  38.5 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  39.69 
 
 		 415 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  36.34 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  36.1 
 
 		 414 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  36.24 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  39.61 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  36.04 
 
 		 403 aa  229  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  35.93 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  38.81 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  37.23 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  39.49 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  39.55 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  37.28 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  37.53 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  36.59 
 
 		 417 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  36.59 
 
 		 427 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  35.85 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  35.66 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  34.11 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  34.11 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  37.66 
 
 		 419 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  35.07 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  37.38 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  36.2 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  36.9 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  33.33 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  31.02 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  35.51 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  38.72 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  37.53 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  35.63 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  35 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  31.54 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  32.49 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  31.63 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  34.43 
 
 		 406 aa  152  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30 
 
 		 346 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.31 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  31.18 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.41 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.19 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  28.81 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  25.82 
 
 		 340 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.12 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  31.35 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.04 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.74 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.1 
 
 		 461 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.72 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  28.21 
 
 		 341 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.84 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  27.95 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.78 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.7 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  28.19 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.18 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.09 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  27.81 
 
 		 341 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  26.18 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  26.82 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.52 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.13 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.48 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.11 
 
 		 450 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.51 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.24 
 
 		 439 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  27.73 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  26.28 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  26.24 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  28.18 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.02 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.93 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  26.49 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  29.1 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  27.15 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  26.87 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  25.5 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  26.87 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.93 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  25.45 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.74 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  25.38 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>