153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0015 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  62.45 
 
 		 279 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  58.93 
 
 		 280 aa  351  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  57.89 
 
 		 279 aa  351  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  59.57 
 
 		 279 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  59.57 
 
 		 279 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  59.21 
 
 		 279 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  60.29 
 
 		 279 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  58.12 
 
 		 290 aa  345  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  57.4 
 
 		 279 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  58.12 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  58.12 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  57.4 
 
 		 279 aa  341  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  58.12 
 
 		 279 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  58.12 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  58.12 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  58.12 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  57.04 
 
 		 279 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  58.12 
 
 		 279 aa  338  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  57.76 
 
 		 279 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  57.04 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  56.32 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  55.96 
 
 		 279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  47 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  34.17 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  36.39 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  35.91 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  34.95 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  34.67 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  34.59 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  34.3 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  36.93 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  31.17 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  35.97 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  35.4 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  32.34 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  33.72 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  31.77 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  28.53 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.85 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  26.78 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  36.75 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  39.66 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  33.08 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.55 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.9 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.9 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  37.93 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  36.7 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  30.42 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  34.78 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  37.04 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  30.03 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  42.2 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00880  conserved hypothetical protein  38.83 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  26.03 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  24.92 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05542  conserved hypothetical protein  42.39 
 
 		 414 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0412788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.34 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  30.5 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.31 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  39.32 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  28.9 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  41.35 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  26.83 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  25.97 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  33.33 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00580  expressed protein  34.82 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0611679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  29.08 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  39.81 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  28.36 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  37.29 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  29.05 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  35.9 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  30.29 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  26.03 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  39.81 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  34.19 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  34.19 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  27.01 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  41.46 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  27.55 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  36.7 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  36.7 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  36.7 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  32.41 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  35.59 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  27.92 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.41 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  30.82 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  40.45 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  35.4 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>