10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0010 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0010  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000496254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2657  hypothetical protein  52.56 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.254628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1791  hypothetical protein  52.43 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2590  hypothetical protein  52.29 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.887746  normal  0.25419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1218  hypothetical protein  52.29 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1222  hypothetical protein  48.78 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0552  hypothetical protein  53.77 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2919  hypothetical protein  44.69 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1819  hypothetical protein  44.98 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0977  hypothetical protein  33.04 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0316488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>