More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1802 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  94.92 
 
 
73 bp  93.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  94.92 
 
 
73 bp  93.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  97.67 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0026  tRNA-Asn  91.8 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2604  tRNA-Asn  91.8 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  95.24 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  85.71 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0453  tRNA-Lys  94.74 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000219585  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0012  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0011  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1581  tRNA-Lys  88.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1616  tRNA-Lys  88.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.620085 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 
79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0060  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  94.44 
 
 
78 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0047  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479856  normal  0.63722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0048  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.645355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0049  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.666985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>