More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1884 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  100 
 
 
447 aa  889  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  1.4456e-12 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  64.57 
 
 
434 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  33.73 
 
 
439 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  32.09 
 
 
441 aa  219  8e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  29.66 
 
 
453 aa  214  2e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  31.02 
 
 
446 aa  212  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
460 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  32.08 
 
 
457 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  31.07 
 
 
452 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  31.07 
 
 
452 aa  197  5e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  30.84 
 
 
452 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  28.77 
 
 
464 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.85 
 
 
445 aa  186  1e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.85 
 
 
438 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.85 
 
 
452 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27.31 
 
 
443 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  27.31 
 
 
443 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27.31 
 
 
443 aa  180  5e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27.31 
 
 
443 aa  180  5e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27.31 
 
 
443 aa  180  5e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27.31 
 
 
443 aa  180  5e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
443 aa  180  5e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  31.78 
 
 
443 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.48 
 
 
468 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27.31 
 
 
443 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.71 
 
 
468 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.48 
 
 
468 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.48 
 
 
468 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.48 
 
 
468 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  30.43 
 
 
442 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  29.98 
 
 
442 aa  173  4e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  29.66 
 
 
442 aa  166  7e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
445 aa  165  2e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.3 
 
 
457 aa  164  2e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
445 aa  164  4e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89575e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  29.45 
 
 
445 aa  164  4e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 
469 aa  164  4e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
445 aa  164  4e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  29.45 
 
 
445 aa  164  4e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  29.45 
 
 
445 aa  164  4e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
445 aa  163  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.39 
 
 
480 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  26.71 
 
 
458 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  26.93 
 
 
468 aa  135  1e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
423 aa  129  8e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.52 
 
 
476 aa  128  2e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  24.86 
 
 
465 aa  115  1e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
465 aa  115  1e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  26.35 
 
 
427 aa  114  4e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  26.37 
 
 
526 aa  113  8e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  24.89 
 
 
473 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  25.97 
 
 
475 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 
489 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  26.12 
 
 
489 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  26.12 
 
 
489 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  24.32 
 
 
447 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  25.49 
 
 
475 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  25.49 
 
 
475 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  25.49 
 
 
475 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.15 
 
 
462 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  26.12 
 
 
489 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  26.32 
 
 
473 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  24.88 
 
 
474 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  24.93 
 
 
438 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.23 
 
 
474 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.73666e-10  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  24.49 
 
 
455 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
451 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.65 
 
 
474 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
460 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  26.01 
 
 
465 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.53 
 
 
454 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  23.89 
 
 
471 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  24.27 
 
 
455 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  24.42 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  25.88 
 
 
485 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.13 
 
 
487 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.32 
 
 
485 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  23.9 
 
 
474 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  26.39 
 
 
466 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  25.47 
 
 
458 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  25.47 
 
 
458 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  24.16 
 
 
438 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  24.94 
 
 
464 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.05 
 
 
472 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  25.63 
 
 
485 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  26.98 
 
 
487 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  26.98 
 
 
487 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  23.11 
 
 
499 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  22.6 
 
 
478 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  26.56 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  22.6 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  22.6 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  22.6 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  22.6 
 
 
478 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  22.22 
 
 
457 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  22.6 
 
 
478 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  23.32 
 
 
476 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>