More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1867 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 455 aa  897    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1865  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.25 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000195925  hitchhiker  0.00000000000416015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.14 
 
 		 438 aa  588  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.43 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.67 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0499  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.37 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000767859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.68 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  51.49 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  51.49 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  51.49 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  51.49 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 		 431 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  51.49 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.32 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  51.26 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.26 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  51.26 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  51.49 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  49.21 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  51.49 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.8 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.85 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.85 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.97 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.81 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.75 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.75 
 
 		 431 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.75 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.75 
 
 		 431 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  47.09 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  46.85 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.28 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  45.12 
 
 		 431 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.47 
 
 		 433 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  44.88 
 
 		 431 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.05 
 
 		 431 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  45.56 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.95 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.19 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  44.63 
 
 		 429 aa  353  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.41 
 
 		 433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  44.58 
 
 		 431 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  44.86 
 
 		 429 aa  352  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.75 
 
 		 431 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.86 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.72 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.44 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  44.73 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.09 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.09 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.58 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.6 
 
 		 442 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.72 
 
 		 440 aa  338  8e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.86 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  43.93 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.97 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.78 
 
 		 432 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3466  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.52 
 
 		 433 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.48 
 
 		 436 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.5 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  44.1 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  41.59 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  42 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.2 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  42 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  42.6 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  42.6 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  42.6 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  41.76 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  41.76 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  41.76 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  41.76 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  41.76 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  41.76 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.22 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.69 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  42.24 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.69 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  42.76 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.05 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.27 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  42.47 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0666  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.94 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.69 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  41.74 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.05 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4526  xanthine/uracil permease family protein  41.76 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.190363 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.05 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  41.92 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.05 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.47 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.27 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.04 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  41.31 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.47 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  41.61 
 
 		 465 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  41.61 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0631  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000126006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>