58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1834 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1834  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  449  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.320572 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1237  protein of unknown function DUF969  47.49 
 
 
221 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1372  hypothetical protein  49.05 
 
 
230 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.157148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1415  hypothetical protein  45.85 
 
 
226 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0773605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1680  hypothetical protein  45.85 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.936458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0177  hypothetical protein  43.24 
 
 
224 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000813125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1378  hypothetical protein  41.18 
 
 
230 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0577  hypothetical protein  40.72 
 
 
230 aa  154  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0656  hypothetical protein  40.72 
 
 
230 aa  154  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2570  protein of unknown function DUF969  39.17 
 
 
228 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3959  hypothetical protein  37.16 
 
 
229 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3452  hypothetical protein  36.7 
 
 
229 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.159434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0437  protein of unknown function DUF969  37.62 
 
 
223 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000406355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1182  protein of unknown function DUF969  37.34 
 
 
239 aa  148  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0192  hypothetical protein  39.73 
 
 
249 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3744  protein of unknown function DUF969  39.27 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.79738  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0020  hypothetical protein  39.42 
 
 
246 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2013  hypothetical protein  34.86 
 
 
229 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319899  normal  0.403491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5731  hypothetical protein  38.33 
 
 
249 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2480  hypothetical protein  38.53 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4532  hypothetical protein  35.32 
 
 
229 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1258  hypothetical protein  41.28 
 
 
243 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0785505  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4059  hypothetical protein  34.4 
 
 
229 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4307  hypothetical protein  34.4 
 
 
229 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3466  hypothetical protein  34.4 
 
 
229 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553486  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1217  hypothetical protein  37.9 
 
 
239 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414254  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3085  hypothetical protein  38.91 
 
 
233 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3099  hypothetical protein  38.91 
 
 
233 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6525  protein of unknown function DUF969  37.12 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120098  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0873  hypothetical protein  37.61 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2871  hypothetical protein  38.05 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3094  hypothetical protein  38.46 
 
 
234 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2879  hypothetical protein  38.46 
 
 
234 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.225033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2168  hypothetical protein  37.56 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.202836  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2151  hypothetical protein  38.53 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2846  permease  38.53 
 
 
230 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3118  hypothetical protein  38.53 
 
 
231 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2807  permease  38.01 
 
 
234 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3117  hypothetical protein  38.53 
 
 
231 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3592  hypothetical protein  39.63 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1170  hypothetical protein  39.63 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000118885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1118  hypothetical protein  39.63 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0005  hypothetical protein  35.96 
 
 
261 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0933  hypothetical protein  36.11 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262874  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0065  hypothetical protein  39.05 
 
 
244 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0090  hypothetical protein  38.36 
 
 
243 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2906  hypothetical protein  37.33 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2371  protein of unknown function DUF969  36.76 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1601  normal  0.836703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1971  protein of unknown function DUF969  36.76 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988199  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2977  hypothetical protein  37.16 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.226934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3291  protein of unknown function DUF969  35.78 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0250  hypothetical protein  37.16 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0263  hypothetical protein  37.16 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3371  hypothetical protein  37.16 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0446  hypothetical protein  37.16 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2114  hypothetical protein  37.16 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0227  hypothetical protein  37.44 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2881  protein of unknown function DUF969  37.5 
 
 
236 aa  121  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>