More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1760 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 199 aa  418  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  33.67 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.06 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  32.97 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.3 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  30.3 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  30.3 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.09 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  30.3 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.8 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.8 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.92 
 
 		 442 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.8 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  25.74 
 
 		 447 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  30.3 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.03 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.03 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.48 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.03 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  32.71 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.16 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.63 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.16 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.16 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.36 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 		 445 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.03 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  26.37 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.64 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  27.86 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  27.86 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  27.86 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.29 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  26.21 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  27.36 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.85 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.82 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  25 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.09 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  30.49 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.79 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.84 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  26.09 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  25.93 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  30.57 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.11 
 
 		 442 aa  72  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  25.93 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  28.28 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28 
 
 		 442 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  28.79 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  27.36 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  27.59 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>