298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1746 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  100 
 
 
308 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  59.25 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  51.79 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  41.42 
 
 
345 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  42.37 
 
 
312 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  43.58 
 
 
297 aa  226  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  42.91 
 
 
323 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  45.28 
 
 
321 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  41.09 
 
 
320 aa  219  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  44.11 
 
 
323 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  43.77 
 
 
323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  39.93 
 
 
342 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  41.06 
 
 
325 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  42.97 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  39.3 
 
 
305 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  37.32 
 
 
358 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  35.03 
 
 
361 aa  193  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  36.06 
 
 
360 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  34.11 
 
 
366 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 
381 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  34.98 
 
 
348 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  36.51 
 
 
371 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 
380 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 
350 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.55 
 
 
353 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  35.91 
 
 
326 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 
330 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.26 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  32.19 
 
 
339 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.22 
 
 
363 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.34 
 
 
339 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  31.62 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 
338 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.48 
 
 
346 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.75 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.43 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.42 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 
317 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.02 
 
 
328 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  36.77 
 
 
349 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.93 
 
 
313 aa  122  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.9 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  35.87 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.66 
 
 
353 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  34.21 
 
 
346 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  34.21 
 
 
346 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 
389 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  31.76 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.49 
 
 
379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.85 
 
 
336 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.3 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  28.85 
 
 
417 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  33.04 
 
 
315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  30.8 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  36 
 
 
340 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.74 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  31.39 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  33.49 
 
 
340 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 
386 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  27.31 
 
 
368 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2090  ApbE family lipoprotein  26.78 
 
 
427 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  29.08 
 
 
345 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  26.94 
 
 
365 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  26.57 
 
 
331 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  30.8 
 
 
344 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  31.44 
 
 
308 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 
343 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  34.12 
 
 
362 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.56 
 
 
361 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.49 
 
 
336 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  27.48 
 
 
329 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  29.01 
 
 
300 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.51 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  31.78 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  29.01 
 
 
300 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  31.31 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  31.31 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  32.13 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  29.76 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  26.91 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  27.23 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  26.49 
 
 
338 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  24.65 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  30.29 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  30.84 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  28.85 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.44 
 
 
351 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.63 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  30.84 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.63 
 
 
350 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.92 
 
 
349 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  30.27 
 
 
352 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  30.27 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  29.62 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.63 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.85 
 
 
362 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>