More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1722 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  67.35 
 
 
297 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  48.21 
 
 
293 aa  255  8e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  47.06 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  44.41 
 
 
308 aa  246  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  42.09 
 
 
303 aa  235  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  35.21 
 
 
312 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 
310 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  32.27 
 
 
294 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 
309 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  34.67 
 
 
329 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  30.34 
 
 
330 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  26.3 
 
 
297 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 
304 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 
322 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  31.2 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  31.2 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  31.2 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  30.1 
 
 
316 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 
313 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  30.8 
 
 
304 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  29.91 
 
 
321 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  30.4 
 
 
304 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  33.73 
 
 
393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.73 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.73 
 
 
312 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.73 
 
 
320 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.73 
 
 
320 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.33 
 
 
320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  33.73 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  33.2 
 
 
333 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 
328 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  31.08 
 
 
309 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  29.93 
 
 
398 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 
312 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 
310 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 
317 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  28.06 
 
 
307 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  26.21 
 
 
339 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  28.21 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 
306 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.16 
 
 
301 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  23.68 
 
 
304 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  25.71 
 
 
511 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  26.01 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.57 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  32.11 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  25.68 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  25.68 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  24.41 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  28.22 
 
 
326 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  22.92 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  24.05 
 
 
337 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  27.23 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 
294 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.78 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 
346 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.4 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.78 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.62 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.94 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.62 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  26.62 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.19 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  25.19 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  23.72 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.71 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.09 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  25 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  24.24 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  23.37 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.48 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  27.16 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  23.36 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  26.74 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  23.79 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.21 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  30.23 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  22.43 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  25.76 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  22.48 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.25 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.01 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>