165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1695 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1695  amino acid transporter  100 
 
 		 480 aa  972    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00330646  decreased coverage  1.25344e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  51.79 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  38.33 
 
 		 473 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  38.33 
 
 		 473 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  38.33 
 
 		 473 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  38.33 
 
 		 473 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  38.33 
 
 		 473 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  37.92 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  37.92 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  37.92 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  37.92 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  37.92 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  37.71 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  37.92 
 
 		 540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  37.92 
 
 		 540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2332  amino acid permease family protein  38.98 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2046  amino acid permease family protein  38.56 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  34.59 
 
 		 516 aa  269  8.999999999999999e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.53 
 
 		 489 aa  143  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.53 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  23.82 
 
 		 495 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  23.82 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  23.04 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  24.19 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 497 aa  103  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  21.95 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  21.95 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  21.95 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  21.95 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  22.68 
 
 		 477 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  22.28 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  22.28 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  22.99 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  22.46 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  22.28 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  23.56 
 
 		 502 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  25.57 
 
 		 472 aa  87.4  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  22.16 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  21.55 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  20.85 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  21.08 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  21.08 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  21.08 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  20.71 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  21.08 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  21.08 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  21.02 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  23.31 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  20.85 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  22.36 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  22.73 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  24 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  25.34 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  23.73 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  20.8 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  22.66 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  20.52 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  21.87 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  21.87 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  22.66 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  21.25 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  21.25 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  21.25 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  21.25 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  20.97 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  21.33 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4742  inner membrane transporter YjeM  21.23 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  22.9 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  22.9 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  19.78 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  21.96 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  21.96 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  21.96 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  21.96 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  26.19 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  26.19 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  22.1 
 
 		 459 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  20.87 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 462 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 481 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  19.63 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  19.63 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  22.67 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  19.63 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  19.63 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  19.63 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>